БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 10, с. 1368–1381
УДК 577.023+577.322.23
Механизм переноса электронов в химерном белке цитохром b5-NADH-цитохром b5-редуктазе*
Институт биоорганической химии НАН Беларуси
Поступила в редакцию 26.02.2008
После доработки 28.03.2008
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: микросомальный цитохром b5, экспрессия в Escherichia coli, аффинная хроматография, очистка, электронный транспорт, химерный флавогемопротеин.
Аннотация
В настоящей работе приведены результаты по конструированию, гетерологической экспрессии в клетках Escherichia coli, выделению, очистке и физико-химической характеристике химерного белка, состоящего из цитохрома b5 и NADH-цитохром b5-редуктазы. Проведены кинетические исследования реакции переноса электронов между NADH-цитохром b5-редуктазой и цитохромом b5 в рамках химерного белка, включающего гидрофильный домен цитохрома b5 (94 аминокислоты) и укороченную с N-конца (Δ23) NADH-цитохром b5-редуктазу (277 аминокислот). Показано, что перенос электронов происходит между флавином и гемом редокс-партнеров, принадлежащих двум различным молекулам химерного белка, а для кофактора FAD характерна значительная подвижность относительно белковой глобулы флавопротеида, о чем свидетельствуют результаты измерений анизотропии флуоресценции. С использованием компьютерного моделирования построена модель пространственной структуры химерного белка, которая находится в соответствии с полученными экспериментальными данными; расстояние между FAD и железом гема составляет >50 Å. С использованием теории переноса электронов в полярных средах Р. Маркуса показана неадекватность гипотезы электростатического «отталкивания», предложенной для объяснения увеличения скорости реакции переноса электронов при повышении концентрации ионов в среде за счет снижения силы электростатического отталкивания одноименных зарядов. Истинной причиной увеличения константы скорости реакции переноса электронов между NADH-цитохром b5-редуктазой и цитохромом b5 в рамках химерного белка, как показано в настоящей работе, является уменьшение энергии реорганизации среды, приводящее к снижению энергии активации окислительно-восстановительной реакции.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM08-064, 01.06.2008.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.