БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 8, с. 1101–1113
УДК 577.214
Взаимодействие факторов эксцизионной репарации нуклеотидов XPC–HR23B, XPA и RPA с поврежденной ДНК*
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
2 Новосибирский государственный университет
3 Химический факультет, МГУ им. М.В. Ломоносова
4 Department of Pharmalogical Sciences, SUNY Stony Brook
Поступила в редакцию 20.12.2007
После доработки 18.03.2008
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: факторы эксцизионной репарации нуклеотидов, фотоаффинная модификация, фотореакционноспособные олигонуклеотиды, комплексообразование.
Аннотация
Исследовано взаимодействие белков, участвующих в процессе эксцизионной репарации нуклеотидов – фактора Xeroderma pigmentosum комплементационной группы С в комплексе с гомологом дрожжевого белка Rad23 (XPC–HR23B), репликативного белка А (RPA) и фактора Xeroderma pigmentosum комплементационной группы А (XPA) – с 48-мерными ДНК-дуплексами, моделирующими поврежденную ДНК. Показано, что все исследуемые белки демонстрируют незначительное предпочтение в связывании поврежденной ДНК по сравнению с нативным ДНК-дуплексом. RPA стимулирует образование комплексов XPC–HR23B с ДНК, при совместном присутствии ХРА и XPC–HR23B в реакционной смеси наблюдается синергизм во взаимодействии этих белков с ДНК. RPA образует ковалентные сшивки с ДНК, содержащими фотореакционноспособный остаток 5I-dUMP в одной цепи и повреждение в виде флуоресцеин-замещенного производного dUMP в противоположной цепи дуплекса, а также стимулирует образование ковалентных сшивок XPC–HR23B с ДНК. Следовательно, RPA может являться одним из основных регуляторов процесса эксцизионной репарации нуклеотидов на различных его этапах. Полученные данные свидетельствуют в пользу модели кооперативного связывания белков, участвующих в формировании предрасщепляющего комплекса, с ДНК-дуплексами, несущими повреждения.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in press, BM07-426.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.