БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 6, с. 822–832
УДК 577.1
Хеликаза/NTPаза вируса гепатита C: эффективная система экспрессии и новые ингибиторы*
1 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
2 Университет Осло, Центр медицинских исследований в Москве
Поступила в редакцию 09.11.2007
После доработки 18.12.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: вирус гепатита C, белок NS3, NТРаза, хеликаза, аналоги NТР, аналоги неорганического пирофосфата.
Аннотация
Разработан метод получения рекомбинантного полноразмерного белка NS3 вируса гепатита C с выходом 6,5 мг/л клеточной культуры и оптимизированы условия измерения его NТРазной и хеликазной активностей. Показано, что хеликазная реакция может протекать в двух режимах в зависимости от соотношения концентраций фермента и субстрата: в некаталитическом АТР-независимом при избытке фермента, и в каталитическом при десятикратном избытке субстрата. В последнем случае хеликазная активность сопряжена с NТРазной и стимулируется АТР. Исследован ряд аналогов NТР и неорганического пирофосфата в качестве субстратов и/или ингибиторов NТРазной активности белка NS3 и показано, что структура нуклеинового основания и рибозного фрагмента молекулы NTP мало сказывается на его ингибиторных (субстратных) свойствах. Установлено, что среди производных нуклеотидов наиболее эффективный ингибитор NТРазной реакции – 5′-фосфорил-β,γ-гипофосфат 2′-дезокситимидина, а среди аналогов пирофосфата максимальную ингибирующую активность проявлял иминодифосфат. Эти соединения исследованы как ингибиторы хеликазной реакции и показано, что иминодифосфат эффективно ингибирует АТР-зависимую хеликазную реакцию, практически не оказывая воздействия на АТР-независимое расплетание дуплекса. В то же время ингибирующее действие 5′-фосфорил-β,γ-гипофосфата 2′-дезокситимидина было незначительным в обоих случаях, что, вероятно, связано с возможностью активации хеликазы данным аналогом ATP.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM07-367, 06.04.2008.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.