БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 4, с. 542–552
УДК 577.1
Новые ДНК-гликозилазы из Mycobacterium tuberculosis*
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Поступила в редакцию 21.09.2007
После доработки 29.10.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: окислительный стресс, репарация ДНК, ДНК-гликозилазы, Mycobacterium tuberculosis.
Аннотация
В удалении окисленных оснований из ДНК Escherichia coli участвуют два фермента, формамидопиримидин-ДНК-гликозилаза (Eco-Fpg) и эндонуклеаза VIII (Eco-Nei), принадлежащие к одному структурному семейству Fpg/Nei. В геноме актиномицетов обнаружены несколько гомологов этих ферментов, до настоящего времени не охарактеризованные. Были клонированы и экспрессированы два паралога (Mtu-Nei2 и Mtu-Fpg2) из изолятов 36KAZ и KHA94 Mycobacterium tuberculosis и исследована их способность участвовать в репарации ДНК. Показано, что при гетерологичной экспрессии в E. coli Mtu-Nei2 понижал частоту спонтанных мутаций в гене rpoB, в то время как Mtu-Fpg2 умеренно повышал ее, что может быть связано с отсутствием в этом белке остатков, критически важных для катализа. Mtu-Nei2 проявлял высокую активность по отношению к двухцепочечным ДНК-субстратам, содержащим остатки дигидроурацила и апурин-апиримидиновые сайты, а также был способен с меньшей эффективностью расщеплять субстраты, содержащие остатки 8-оксогуанина и урацила. Эти повреждения, а также остатки 8-оксоаденина, узнавались и удалялись ферментом из одноцепочечной ДНК. Гомологи Fpg и Nei из M. tuberculosis могут играть важную роль в защите бактерий от генотоксического стресса, вызванного окислительным взрывом в макрофагах.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM07-319, 24.02.08.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.