БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 4, с. 498–503
УДК 577.124
Структура и характеристика генного кластера О-антигена Escherichia coli O49, содержащего 4,6-дидезокси-4-[(S)-3-гидроксибутаноиламино]-D-глюкозу*
1 Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН
2 TEDA School of Biological Sciences and Biotechnology Nankai University
3 Tianjin Key Laboratory for Microbial Functional Genomics, TEDA College, Nankai University
Поступила в редакцию 11.07.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Escherichia coli, липополисахарид, структура бактериального полисахарида, 3-гидроксибутират, 4-амино-4,6-дидезокси-D-глюкоза, генный кластер О-антигена.
Аннотация
О-полисахарид выделен мягкой кислотной деградацией липополисахарида энтеропатогенной бактерии Escherichia coli O49 и исследован методами моносахаридного анализа и одномерной и двумерной спектроскопии 1H- и 13C-ЯМР. Установлена структура линейного тетрасахаридного повторяющегося звена О-полисахарида.
→2)-α-D-Quip4N(S3HOBut)-(1→4)-β-D-GalpNAc-(1→4)-α-L-Rhap-(1→3)-β-D-GlcpNAc6Ac-(1→ ,
где D-Qui4N(S3HOBut) обозначает 4,6-дидезокси-4-[(S)-3-гидроксибутаноиламино]-D-глюкозу и остаток GlcNAc О-ацетилирован частично (~30%). По нашим данным, N-(3-гидроксибутаноильное) производное Qui4N ранее не было обнаружено в составе бактериальных полисахаридов. Функции генов в кластере, отвечающем за биосинтез О-антигена E. coli O49, определенные на основании биоинформационного анализа, соответствуют структуре О-полисахарида. Обнаружены два новых гена, предположительно отвечающих за синтез и перенос 3-гидроксибутаноильной группы.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM07-237, 11.11.2007.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.