Анализ атомных пар, образующих контакт белковых молекул

Аннотация

Проведен анализ взаимосвязи между значением свободной энергии связывания белков и числом пар атомов, участвующих в образовании этой связи (интерфейса) и межатомным расстоянии в этих парах. Использовалась выборка из 69 белковых комплексов. Найдено, что образующие интерфейс пары атомов основной цепи вносят больший вклад в корреляцию по сравнению с боковыми цепями, а пары полярных атомов – больше, чем пары неполярных. Образующие интерфейс пары атомов с межатомными расстояниями, лежащими в диапазоне от 6 до 12 Е, представляют наибольшую важность для объяснения различий в значениях свободных энергиях связывания в исследованных комплексах.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: