БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 2, с. 193–201
УДК 577.218
5S рРНК-узнающий модуль белков семейства СТС и его эволюция
Институт белка РАН
Поступила в редакцию 27.06.2007
После доработки 28.09.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: бактериальные 5S рРНК-связывающие белки, белки семейства СТС, рибосома.
Аннотация
Проведен анализ влияния аминокислотных замен в РНК-связывающих участках гомологичных рибосомных белков TL5 и L25, принадлежащих к семейству СТС, на способность этих белков образовывать комплексы с рибосомной 5S РНК. Показано, что одновременные замены на аланин даже трех неконсервативных аминокислотных остатков в РНК-связывающем участке белка не приводят к существенному изменению стабильности комплекса TL5-5S рРНК. Тогда как замена любого из пяти консервативных остатков РНК-связывающего участка как в TL5, так и в L25 приводит к сильной дестабилизации или полной невозможности образования комплекса. Именно эти пять остатков формируют РНК-узнающий модуль в данных белках. Они строго консервативны в белках семейства СТС. Имеются, однако, несколько случаев природных замен этих остатков в гомологах данных белков в Bacilli и Cyanobacteria, которые сопровождаются определенными заменами и во взаимодействующем с СТС участке 5S рРНК соответствующего организма. Мы выделили белки СТС и фрагменты 5S рРНК Enterococcus faecalis и Nostoc sp. и проверили их способность образовывать специфические комплексы. Оказалось, что данные белки образуют стабильный и специфический комплекс только с 5S рРНК той же бактерии. Эти случаи – пример коэволюции структур двух взаимодействующих макромолекул.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.