БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 2, с. 193–201

УДК 577.218

5S рРНК-узнающий модуль белков семейства СТС и его эволюция

© 2008 А.В. Коробейникова, Г.М. Гонгадзе *, А.П. Корепанов, Б.Д. Елисеев, М.В. Баженова, М.Б. Гарбер

Институт белка РАН

Поступила в редакцию 27.06.2007
После доработки 28.09.2007

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: бактериальные 5S рРНК-связывающие белки, белки семейства СТС, рибосома.

Аннотация

Проведен анализ влияния аминокислотных замен в РНК-связывающих участках гомологичных рибосомных белков TL5 и L25, принадлежащих к семейству СТС, на способность этих белков образовывать комплексы с рибосомной 5S РНК. Показано, что одновременные замены на аланин даже трех неконсервативных аминокислотных остатков в РНК-связывающем участке белка не приводят к существенному изменению стабильности комплекса TL5-5S рРНК. Тогда как замена любого из пяти консервативных остатков РНК-связывающего участка как в TL5, так и в L25 приводит к сильной дестабилизации или полной невозможности образования комплекса. Именно эти пять остатков формируют РНК-узнающий модуль в данных белках. Они строго консервативны в белках семейства СТС. Имеются, однако, несколько случаев природных замен этих остатков в гомологах данных белков в Bacilli и Cyanobacteria, которые сопровождаются определенными заменами и во взаимодействующем с СТС участке 5S рРНК соответствующего организма. Мы выделили белки СТС и фрагменты 5S рРНК Enterococcus faecalis и Nostoc sp. и проверили их способность образовывать специфические комплексы. Оказалось, что данные белки образуют стабильный и специфический комплекс только с 5S рРНК той же бактерии. Эти случаи – пример коэволюции структур двух взаимодействующих макромолекул.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.