БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 2, с. 173–184
УДК 577.152
Влияние условий культивирования на пространственную структуру и функцинальную активность OmpF-подобного порина из наружной мембраны Yersinia pseudotuberculosis*
1 Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН
2 Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
Поступила в редакцию 26.06.2007
После доработки 28.07.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: неспецифические OmpF-подобные порины, пространственная структура, термостабильность, функциональная активность, липидный матрикс.
Аннотация
С помощью методов оптической спектроскопии, сканирующей микрокалориметрии и техники бислойных липидных мембран изучено влияние условий культивирования бактерий псевдотуберкулеза на пространственную структуру и функциональную активность неспецифического OmpF-подобного порина. Для этого были охарактеризованы образцы поринов, полученные из микробной массы, выращенной при различной температуре, плотности питательной среды и фазы роста микроорганизмов. Согласно данным КД исследуемые образцы порина являются β-структурированными белками. Обнаружено, что белок, выделенный из колониальной культуры бактерий псевдотуберкулеза, выращенной при низкой температуре, имеет наиболее компактную структуру. Методом измерения собственной белковой флуоресценции показано, что варьирование условий культивирования бактерий псевдотуберкулеза приводит к изменениям в спектрах флуоресценции порина за счет перераспределения вкладов остатков тирозина и различных типов триптофанилов в суммарную эмиссию белка. Тепловая денатурация образцов порина исследована методами КД, собственной белковой флуоресценции и сканирующей микрокалориметрии. Обнаружено, что особенности пространственной структуры исследуемых образцов порина влияют на их функциональную активность. Совокупность полученных данных позволяет провести корреляцию между составом липидного матрикса и пространственной структурой OmpF-подобных поринов, наружной мембраны грамотрицательных бактерий.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM07-211, 26.06.2007.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.