БИОХИМИЯ, 2008, том 73, вып. 1, с. 86–92
УДК 577.113.004.5
Выявление генов-мишеней транскрипционных факторов FOXA, связанных с регуляцией пролиферации*
Институт цитологии и генетики СО РАН
Поступила в редакцию 02.07.2007
После доработки 12.07.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: факторы транскрипции FOXA, гены-мишени, регуляция пролиферации, печень.
Аннотация
В целях выяснения механизма опухолесупрессорного действия белков FOXA в печени проведен поиск потенциальных генов-мишеней этих транскрипционных факторов, связанных с регуляцией пролиферации. На первом этапе использованы опубликованные данные анализа экспрессии генов в печени (высокое содержание белков FOXA) и почке (экспрессия FOXA отсутствует) мыши, полученные с помощью гибридизации на микрочипах. В регуляторных районах 40 дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с регуляцией пролиферации, проведен поиск сайтов связывания FOXA компьютерным методом SITECON. Выявлено 11 генов, содержащих кластеры потенциальных сайтов FOXA, включающих в себя 3–6-кратные повторы TTTG. Методом задержки в геле с использованием GST-слитого белка, содержащего ДНК-связывающий домен FOXA2, подтверждено специфическое взаимодействие FOXA с такими микросателлитными сайтами. Отобрано шесть генов, содержащих кластеры подтвержденных сайтов связывания: Cul2, Cdc73, Ptk, Pdcd, Creb, Ppp2r5d. Методом ПЦР в реальном времени исследовано влияние гепатоканцерогена ортоаминоазотолуола (ОАТ), который приводит к снижению активности FOXA, на экспрессию этих генов. Показано, что под действием ОАТ резко возрастает уровень мРНК генов Cul2 и Cdc73.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Рapers in Рress, BM07-218, 11.11.2007.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.