БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 12, с. 1594–1609
УДК 579.8.063(047)
Геносистематика микроорганизмов термальных местообитаний
Институт микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН
Поступила в редакцию 20.08.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: геносистематика, филогенетическая систематика, иерархическая классификация, прокариоты, археи, бактерии, термофилы.
Аннотация
В термальных местообитаниях развиваются специализированные сообщества термофильных микроорганизмов, в основном прокариотных. Рассматривается современная систематика прокариот и место в ней термофильных архей и бактерий. Среди существующих иерархических классификаций прокариот основное внимание уделяется принятой в текущем втором издании Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology классификации, опирающейся, в первую очередь, на филогению 16S рРНК и фенотипические признаки. Анализ данных геномики показывает, что они в целом согласуются с системой, основанной на 16S рРНК, хотя и выявляют значительность эволюционной роли латерального переноса, дупликации и утраты генов. Согласно классификации, принятой в текущем издании Bergey’s Manual, все культивируемые в настоящее время в лабораторных условиях прокариоты, представляющие узаконенные таксоны, распределяются по 26 типам, два из которых относятся к домену Archaea, и 24 – к Bacteria. При этом шесть типов содержат только термофилов, а еще десять типов содержат термофилов наряду с мезофилами, причем термофилы обычно оказываются обособлены филогенетически, будучи представлены таксонами высокого ранга (класс, порядок). В свете данных по топологии филогенетического дерева 16S рРНК и ряда других данных в обзоре обсуждается возможная гипертермофильная природа всеобщего предка.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.