БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 11, с. 1449–1458
УДК 577.218
Короткие репрезентативные последовательности в структурных и функциональных геномных исследованиях
Обзор
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Поступила в редакцию 15.05.2007
После доработки 09.07.2007
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: функциональная геномика, транскриптом, короткие репрезентативные последовательности, SAGE.
Аннотация
Для преодоления сложностей, связанных с затратами на прямое исследование геномов и транскриптомов, разработаны методы, основанные на использовании коротких репрезентативных последовательностей, однозначно определяющих ген/транскрипт, из которого они происходят. Рассмотрены принципы, лежащие в основе таких подходов и их модификаций, разработанных как для количественной и качественной характеристики транскриптомов, поиска новых транскрибирующихся последовательностей и характеристики промоторных областей генов, так и для крупномасштабной идентификации и картирования различных функциональных геномных сайтов: гипо- и гиперметилированных областей, мест связывания хроматиновых белков, сайтов, расщепляемых ДНКазой I, а также под действием химических или физических факторов.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.