БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 5, с. 655–667

УДК 577.3

Конформационная динамика аналогов гептапептида LDSYQCT – фрагмента α-фетопротеина человека

© 2007 Н.Т. Молдогазиева 1*, А.А. Терентьев 1, А.Н. Казимирский 1, М.Ю. Антонов 2, К.В. Шайтан 2

1 Российский государственный медицинский университет

2 Биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова

Поступила в редакцию 11.08.2006
После доработки 18.01.2007

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: молекулярная динамика, α-фетопротеин, точечные замены, аналоги пептидов.

Аннотация

Методами молекулярной динамики изучены конформационно-динамические свойства одного из биологически активных участков α-фетопротеина – гептапептида LDSYQCT и его аналогов, полученных с помощью точечных замен аминокислотных остатков. Показана значительная консервативность конформационно-динамических свойств пептида при заменах Y17F, Y17S и D15E. Установлено, что замены C19A и S16V вызывают только локальные изменения в динамическом поведении пептида, а химическая модификация цистеина (С19) или димеризация пептида путем образования дисульфидной связи между остатками цистеина двух параллельных пептидных цепей, а также замены C19G, C19S, Q18E и D15N изменяют конформационные возможности и динамическое поведение всех аминокислотных остатков. При этом наиболее существенные изменения происходят при заменах незаряженного аминокислотного остатка на заряженный и наоборот.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.