БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 3, с. 402–406

УДК 577.212.3

«Ложная» пара оснований тимин–1H-енол-гуанин. Применение методов вычислительной химии для объяснения низкой вероятности неверной вставки нуклеотида ДНК-полимеразой

© 2007 E. Секламан 1,2, Л. Курунци 1,2, З. Симон 2*

1 University of Medicine and Pharmacy «Victor Babes»

2 Romanian Academy, Institute of Chemistry Timisoara

Поступила в редакцию 18.09.2006
После доработки 02.11.2006

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: скорость точечной мутации, скорость неверной вставки нуклеотида, ферментативная кинетика Михаэлиса−Ментен, расчет энергетических эффектов в водном растворе, PM3.

Аннотация

Формирование классических нуклеотидных пар TA, GC и «ложной» пары TGенол рассмотрены с точки зрения кинетики Михаэлиса−Ментен при низкой концентрации субстрата. Свободная энергия Гиббса при образовании нуклеотидных пар в водном растворе расcчитана для классических и ложной пар оснований полуэмпирическим методом MNDO/PM3 в вакууме и методом BEM для эффектов гидратации. Полученные результаты свидетельствуют о равных вероятностях вставки для правильного основания и о вероятности ошибки 10–3−10–4 для вставки ложной пары TGенол.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.