БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 3, с. 325–337
УДК 577.152.1
Изучение топографии активного центра дикарбоксилатного транспортера плазматической мембраны Saccharomyces cerevisiae с помощью липофильных производных его субстратов*,**
1 Прикаспийский институт биологических ресурсов ДНЦ РАН
2 Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН
Поступила в редакцию 09.10.2006
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: дикарбоксилатный транспортер плазматической мембраны Saccharomyces cerevisiae, сукцинат, конкурентные ингибиторы транспорта, фумарат, итаконат, 2-алкилмалонаты, O-ацил-L-малаты, липофильный профиль канала переносчика.
Аннотация
Установлено, что 2-алкилмалонаты и O-ацил-L-малаты конкурентно ингибируют дикарбоксилатный транспортер плазматической мембраны клеток Saccharomyces cerevisiae, причем отобранные нами производные субстратов переносчика не проникают через плазмалемму в условиях наших опытов. Зондирование активного центра этого транспортера дикарбоксилатов показало, что на расстоянии 0,72 нм от точки связывания субстрата вплоть до 2,5 нм простирается обширная липофильная зона. Установлено, что итаконат в 5 раз эффективнее L-малата ингибирует транспорт. Это указывает на то, что в непосредственной близости от точки связывания дикарбоксилатов (до 0,72 нм) также имеется гидрофобная область. Отмечено, что переносчик плазмалеммы дрожжей отличается от дикарбоксилатного транспортера печени крысы. В этом переносчике аналогичным методом выявили прилегающую к точке связывания субстрата зону с переменной липофильностью. Продемонстрировано, что она имеет преимущественно гидрофобный характер на расстоянии вплоть до 1,76 нм от точки связывания и разделена гидрофильным сектором на участке от 0,38 до 0,88 нм. Установлено, что фумарат, но не малеат, конкурентно ингибирует транспорт сукцината в клетку S. cerevisiae. Сделано предположение, что переносчик плазмалеммы связывает субстрат в транс-конформации. Обсуждены возможности применения предложенного подхода к сканированию липофильного профиля каналов различных типов транспортеров.
Текст статьи
Сноски
* Ускоренная публикация.
** Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM06–250, 11.02.2007.
*** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.