БИОХИМИЯ, 2007, том 72, вып. 3, с. 325–337

УДК 577.152.1

Изучение топографии активного центра дикарбоксилатного транспортера плазматической мембраны Saccharomyces cerevisiae с помощью липофильных производных его субстратов*,**

© 2007 Д.А. Аливердиева 1***, Д.В. Мамаев 2, Д.И. Бондаренко 2, К.Ф. Шольц

Прикаспийский институт биологических ресурсов ДНЦ РАН

Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН

Поступила в редакцию 09.10.2006

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: дикарбоксилатный транспортер плазматической мембраны Saccharomyces cerevisiae, сукцинат, конкурентные ингибиторы транспорта, фумарат, итаконат, 2-алкилмалонаты, O-ацил-L-малаты, липофильный профиль канала переносчика.

Аннотация

Установлено, что 2-алкилмалонаты и O-ацил-L-малаты конкурентно ингибируют дикарбоксилатный транспортер плазматической мембраны клеток Saccharomyces cerevisiae, причем отобранные нами производные субстратов переносчика не проникают через плазмалемму в условиях наших опытов. Зондирование активного центра этого транспортера дикарбоксилатов показало, что на расстоянии 0,72 нм от точки связывания субстрата вплоть до 2,5 нм простирается обширная липофильная зона. Установлено, что итаконат в 5 раз эффективнее L-малата ингибирует транспорт. Это указывает на то, что в непосредственной близости от точки связывания дикарбоксилатов (до 0,72 нм) также имеется гидрофобная область. Отмечено, что переносчик плазмалеммы дрожжей отличается от дикарбоксилатного транспортера печени крысы. В этом переносчике аналогичным методом выявили прилегающую к точке связывания субстрата зону с переменной липофильностью. Продемонстрировано, что она имеет преимущественно гидрофобный характер на расстоянии вплоть до 1,76 нм от точки связывания и разделена гидрофильным сектором на участке от 0,38 до 0,88 нм. Установлено, что фумарат, но не малеат, конкурентно ингибирует транспорт сукцината в клетку S. cerevisiae. Сделано предположение, что переносчик плазмалеммы связывает субстрат в транс-конформации. Обсуждены возможности применения предложенного подхода к сканированию липофильного профиля каналов различных типов транспортеров.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Ускоренная публикация.

** Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM06–250, 11.02.2007.

*** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.