БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 12, с. 1648–1658
УДК 577.113.4
ДНК-метилтрансфераза SsoII как бифункциональный белок: особенности взаимодействия с промоторной областью генов системы рестрикции-модификации SsoII*
1 Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова
2 Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи РАМН
3 Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии РАСХН
4 НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ им. М.В. Ломоносова
Поступила в редакцию 21.06.2006
После доработки 17.08.2006
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: С5-цитозиновая ДНК-метилтрансфераза, модифицированные олигонуклеотиды, аффинная модификация, 2'-альдегидсодержащая группировка, фосфорилдисульфидная группировка.
Аннотация
Методом аффинной модификации С5-цитозиновой ДНК-метилтрансферазы SsoII ДНК-лигандами, содержавшими альдегидную группу в 2′-положении углеводного фрагмента, продемонстрирована сближенность остатков лизина N-концевой области M.SsoII с углеводофосфатным остовом регуляторного участка промоторной области генов системы рестрикции-модификации SsoII. С помощью ДНК-дуплексов с двумя 2′-альдегидсодержащими группировками показано, что во взаимодействии с регуляторным участком ДНК могут участвовать две субъединицы метилтрансферазы. Изменение нуклеотидной последовательности в одной из половин регуляторного участка препятствует ковалентному связыванию второй субъединицы фермента. Полученные результаты по аффинной модификации M.SsoII последовательно двумя типами модифицированных ДНК-дуплексов (2′-альдегидсодержащим и фосфорилдисульфидсодержащим) продемонстрировали возможность ковалентного присоединения белка сразу к двум различным участкам узнавания ДНК: «регуляторному» участку и участку метилирования.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM06-161, 08.10.2006.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.