БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 11, с. 1459–1468
УДК 577.122
Клонирование и структурный анализ зеиноподобного запасного белка индийского мелкого проса (Panicum sumatrense): участие в агрегации молекул*
1 Centre for Plant Molecular Biology, Tamil Nadu Agricultural University
2 Centro de Analises Proteomicas e Bioquimicas, Pos-Graduacao em Ciencias Genomicas e Biotecnologia, Universidade Catolica de Brasilia
3 Project Trainee, Bioinformatics Center, Indian Institute of Science
Поступила в редакцию 18.01.2006
После доработки 30.05.2006
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: поиск гомологий, молекулярное моделирование, индийское мелкое просо, зеин, филогенетические отношения.
Аннотация
Для клонирования генов зеиноподобных белков, накапливающихся в большом количестве в развивающихся зернах мелкого проса (Panicum sumatrense Roth.), проведена ОТ-ПЦР со специфическими праймерами. Фрагмент кДНК длиной 750 пар оснований был секвенирован, причем in silico анализ показал его высокую степень гомологии с α-проламинами. Отмечено, что в это семейство входят зеины из Zea mays, коиксины из Coix lachryma-jobi и α-кафирины из Sorghum bicolor. В результате сравнения первичных структур идентифицирован потенциальный консервативный домен зеиноподобных белков. Кроме того, последующий анализ показал, что зеиноподобный белок проса образует антипараллельную α-спиральную шпильку с разными поверхностями: гидрофобной и гидрофильной, которая, вероятно, может участвовать в агрегации запасных белков. Исследования зеиноподобных α-проламинов мелкого проса позволят клонировать кодирующие их гены и внедрить их в другие пищевые культуры с низкой пищевой ценностью, такие как хлебные злаки и бобовые.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM06-009, 10.09.2006.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.