БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 10, с. 1312–1327

УДК 577.11

Количественная протеомика и ее применение в системной биологии

Обзор

© 2006 С. Ивахно 1*, А. Корнелюк 2

University of Edinburgh, School of Informatics

Институт молекулярной биологии и генетики

Поступила в редакцию 06.09.2005
После доработки 08.01.2006

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: количественная протеомика, мечение стабильными изотопами, тандемная масс-спектроскопия, протеомная биоинформатика, белок-белковые взаимодействия, системная биология.

Аннотация

В статье рассматривается текущее состояние исследований в быстро растущей области количественной протеомики и ее применения в системной биологии. Методы мечения стабильными изотопами в сочетании с ЖХ-разделением и тандемной масс-спектрометрией дают возможности для высокопроизводительной идентификации и относительного количественного определения белков. Используя как метаболическое, так и химическое мечение белков стабильными изотопами можно проследить с высокой точностью изменения в содержании белков. Количественная протеомика может быть успешно использована для определения изменений относительного содержания белков, обнаружения новых белок-белковых и белок-пептидных взаимодействий, исследования образования больших макромолекулярных комплексов и выявления временных изменений в белковом составе органелл, изменений фосфорилирования в сигнальных каскадах. Более того, количественная протеомика позволяет непосредственно сравнивать активацию полных сигнальных сетей в ответ на индивидуальные воздействия, и обнаруживать критические различия в цепях, ответственных за изменения клеточного ответа. Развитие протеомной биоинформатики и непрерывное усовершенствование технологий протеомики, а также геномики и транскриптомики позволяет сейчас исследовать клеточные механизмы на интегрированном системном уровне.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.