БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 10, с. 1312–1327
УДК 577.11
Количественная протеомика и ее применение в системной биологии
Обзор
1 University of Edinburgh, School of Informatics
2 Институт молекулярной биологии и генетики
Поступила в редакцию 06.09.2005
После доработки 08.01.2006
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: количественная протеомика, мечение стабильными изотопами, тандемная масс-спектроскопия, протеомная биоинформатика, белок-белковые взаимодействия, системная биология.
Аннотация
В статье рассматривается текущее состояние исследований в быстро растущей области количественной протеомики и ее применения в системной биологии. Методы мечения стабильными изотопами в сочетании с ЖХ-разделением и тандемной масс-спектрометрией дают возможности для высокопроизводительной идентификации и относительного количественного определения белков. Используя как метаболическое, так и химическое мечение белков стабильными изотопами можно проследить с высокой точностью изменения в содержании белков. Количественная протеомика может быть успешно использована для определения изменений относительного содержания белков, обнаружения новых белок-белковых и белок-пептидных взаимодействий, исследования образования больших макромолекулярных комплексов и выявления временных изменений в белковом составе органелл, изменений фосфорилирования в сигнальных каскадах. Более того, количественная протеомика позволяет непосредственно сравнивать активацию полных сигнальных сетей в ответ на индивидуальные воздействия, и обнаруживать критические различия в цепях, ответственных за изменения клеточного ответа. Развитие протеомной биоинформатики и непрерывное усовершенствование технологий протеомики, а также геномики и транскриптомики позволяет сейчас исследовать клеточные механизмы на интегрированном системном уровне.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.