БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 8, с. 1119–1128

УДК 577.217

Определение структурно-консервативных аминокислот петли V3 белка GP120 HIV-1 – перспективных «мишеней» для создания лекарственных препаратов методами белковой инженерии

© 2006 А.М. Андрианов 1*, В.Г. Вересов 2

1 Институт биоорганической химии НАН Беларуси

2 Институт биофизики и клеточной инженерии НАН Беларуси

Поступила в редакцию 31.01.2006
После доработки 20.03.2006

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: вирус иммунодефицита человека типа 1, белок gp120, петля V3, пространственная структура, компьютерное моделирование, лекарственные препараты.

Аннотация

С использованием опубликованных данных спектроскопии ЯМР методами компьютерного моделирования построены трехмерные структуры петли V3 белка gp120 HIV-1 в вирусных штаммах HIV-Haiti и HIV-MN. В обоих случаях определены элементы вторичной структуры и конформации нерегулярных участков фрагмента, образующего основную антигенную детерминанту вируса, а также детерминанты клеточного тропизма и образования синцития. Показано, что, несмотря на высокую вариабельность аминокислотной последовательности белка gp120, более 50% остатков петли V3 сохраняют конформации в различающихся вирионах HIV-1. Путем совместного анализа полученных результатов и опубликованных данных о биологической активности индивидуальных остатков петли V3 HIV-1 идентифицированы ее структурно-консервативные аминокислоты, представляющие собой перспективные «мишени» для дизайна противовирусных препаратов методами белковой инженерии.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.