БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 3, с. 342–352
УДК 577.24
Взаимодействие факторов эксцизионной репарации нуклеотидов RPA и XPA с ДНК, содержащей объемные фотореакционноспособные группы, имитирующие повреждения*
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
2 Новосибирский государственный университет
3 Center for Biomedical Genetics, Department of Cell Biology and Genetics, Erasmus Medical Center
Поступила в редакцию 26.08.2005
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: репликативный белок А, факторы эксцизионной репарации нуклеотидов, фотоаффинная модификация, фотореакционноспособные олигонуклеотиды, комплексообразование.
Аннотация
Исследовано взаимодействие белков, участвующих в процессе эксцизионной репарации нуклеотидов (репликативного белка А (RPA) и фактора Xeroderma pigmentosum комплементационной группы А (XPA)) с ДНК-структурами, которые содержат объемные фотореакционноспособные заместители, моделирующие поврежденные нуклеотиды. Отмечено, что эффективности фотоаффинного мечения двух белков варьировали в зависимости от структуры ДНК и типа фотореакционноспособного остатка. Установлено, что при узнавании RPA ключевую роль играет вторичная структура самой ДНК, и в первую очередь наличие в ней протяженных одноцепочечных участков. Исключение составляет эффективно узнаваемый RPA ДНК-дуплекс с объемным заместителем на 5′-конце одноцепочечного разрыва. XPA, с одной стороны, предпочитает структуры с одноцепочечным разрывом и, с другой стороны, с примерно одинаковой эффективностью модифицируется одноцепочечной и двухцепочечной ДНК, содержащей фотореакционноспособную группу внутри цепи. По-видимому, ХРА чувствителен не только к структуре двойной спирали ДНК, но и к объемному заместителю, введенному в ДНК. Обсужден механизм узнавания повреждений в процессе нуклеотидной эксцизионной репарации.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM05-194, 14.12.2005.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.