БИОХИМИЯ, 2006, том 71, вып. 1, с. 26–41
УДК 577.112.34
Идентификация скрытой периодичности в аминокислотных последовательностях белковых семейств*
1 Центр «Биоинженерия» РАН
2 Московский инженерно-физический институт (технический университет)
Поступила в редакцию 24.02.2005
После доработки 16.05.2005
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: скрытая периодичность, выравнивание, информационное разложение.
Аннотация
Для обнаружения скрытой периодичности белковых семейств, выполняющих различные биологические функции, использованы методы информационного разложения и циклического профильного выравнивания, а также метод разложения шума. Скрытая периодичность, специфичная для семейства, выявлена в 94 из 110 проанализированных белковых семейств. Более чем у 70% аминокислотных последовательностей в каждом из этих семейств найдена специфичная для семейства периодичность. На основе таких последовательностей выведен характерный профиль скрытой периодичности каждого семейства. Проанализирована возможная связь между обнаруженной скрытой периодичностью, эволюцией белков и их структурной организацией.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, ВМ 05-052, 23.10.2005.
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.