БИОХИМИЯ, 2005, том 70, вып. 11, с. 1556–1565
УДК 577.152.3
Алифатическая амидаза из Rhodococcus rhodochrous – представитель семейства нитрилаз/цианидгидратаз*
1 Факультет биоинженерии и биоинформатики, НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ им. М.В. Ломоносова
2 Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
Поступила в редакцию 02.03.2005
После доработки 15.03.2005
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: амидаза из Rhodococcus rhodochrous, выравнивание аминокислотных последовательностей, классификация амидаз, специфичность, гидролиз акриламида.
Аннотация
Сравнительное исследование первичной структуры и физико-химических свойств указывает на принадлежность амидазы из Rhodococcus rhodochrous М8 (КФ 3.5.1.4) к семейству нитрилаз/цианидгидратаз. Результаты поиска консервативных блоков и множественного выравнивания позволяют предположить, что Cys-166 – нуклеофил активного центра. Фермент является типичной алифатической амидазой, наиболее активной в отношении короткоцепочечных линейных амидов. Лучшие нуклеофилы в реакциях ацильного переноса, катализируемых амидазой, – полярные небольшого объема молекулы, такие как гидроксиламин и O-метилгидроксиламин. Кинетика ферментативного гидролиза акриламида, имеющего промышленное значение, изучена в широком интервале концентраций субстрата. Обнаружены и изучены процессы ингибирования фермента избытком субстрата и продуктом реакции. Определены кинетическая схема процесса и соответствующие кинетические параметры.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, ВМ05-060, 12.06.2005.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.