Различия контактов РНК-полимераз Еscherichia соli и Thermus aquaticus с lacUV5-промотором определяются кор-ферментом РНК-полимеразы^*

Аннотация

Проведено исследование взаимодействий РНК-полимераз Еscherichia соli и Thermus aquaticus с lacUV5-промотором при разных температурах. С помощью ДНК-белковых сшивок, индуцированных формальдегидом, показано, что каждая РНК-полимераза образует уникальный набор контактов с ДНК в открытом промоторном комплексе. В случае РНК-полимеразы Е. соli сшивку с промотором образуют β’- и σ-субъединицы, а в случае РНК-полимеразы T. aquaticus – β-субъединица. Картина сшивки в промоторных комплексах гибридного холофермента, состоящего из кор-фермента Е. соli и σ-субъединицы T. aquaticus, оказывается сходной с картиной сшивки в случае холофермента Е. соli. Таким образом, характер ДНК-белковых контактов в промоторном комплексе в значительной мере определяется кор-ферментом РНК-полимеразы. В то же время температурная зависимость формирования этих контактов определяется σ-субъединицей. Полученные данные показывают, что метод формальдегидных сшивок может быть использован для выявления различий в структуре промоторных комплексов РНК-полимераз различных бактерий.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: