Молекулярная характеристика OmpF-подобных поринов патогенных Yersinia^*

Аннотация

Неспецифические порообразующие белки (порины) являются основными белками наружной мембраны (НМ) грамотрицательных бактерий, предназначенными для диффузии низкомолекулярных соединений. Клонированы и определены нуклеотидные последовательности OmpF-подобных поринов двух иерсиний Y. pseudotuberculosis (YPS) и Y. enterocolitica (YE). Теоретические значения молекулярных масс (ММ) и изоэлектрических точек (ИЭТ), рассчитанные для этих белков (OmpF-YPS, ММ − 37,7 кДа и ИЭТ – 4,45; OmpF-YE, ММ − 39,5 кДа и ИЭТ 4,34), хорошо согласуются с экспериментальными данными. Выявлена высокая степень гомологии OmpF-подобных поринов иерсиний между собой (83−92%), а также с OmpF-белком S. marcescens (70%); значительно меньшая гомология обнаружена с OmpF-порином E. coli (52−58%). При множественном выравнивании аминокислотных последовательностей зрелых OmpF-белков наблюдается типичная для поринов закономерность в распределении консервативных аминокислотных остатков. Кроме того, для OmpF-поринов иерсиний характерно наличие протяженных областей высокой и низкой гомологии, которые приходятся, соответственно, на трансмембранные домены и «внешние» петли известной топологической модели порина OmpF E. coli. С помощью предсказательных методов получена вторичная структура OmpF-подобных поринов иерсиний. Она представлена 16 β-тяжами, соединенными короткими, «периплазматическими», и более длинными, «внешними», петлями с неупорядоченной структурой.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: