Структурно-функциональные аспекты взаимодействия терминальной дезоксинуклеотидил-трансферазы и аналогов нуклеозид-5'-трифосфатов

Аннотация

Изучены субстратные свойства аналогов нуклеозид-5′-трифосфатов (NTP), а именно, 5′-трифосфатов L- и D-арабинонуклеозидов (D-FIAUTP, D-FMAUTP и L-FMAUTP), D- и L-энантиомеров производных 2′,3′-дидезоксицитидин-5′-трифосфата (ddCTP) – D-ddCTP, L-ddCTP, D-FOddCTP, L-OddCTP и L-SddCTP, и ациклических аналогов гуанозина (ацикловира и пенцикловира) по отношению к терминальной дезокси­нуклеотидилтрансферазе из тимуса теленка (TdT, EC 2.7.7.31). TdT способна многократно включать в 3′-конец праймерного олигонуклеотида D-энантиомеры 5′-трифосфатов аналогов арабинонуклеозидов (D-FIAUTP и D-FMAUTP). В то же время L-энантиомер FMAUTP (L-FMAUTP) не узнается TdT в качестве субстрата. Оценены кинетические параметры D- и L-энантиомеров ddCTP, а также 5′-трифосфатов ациклических нуклеозидов. Показано, что стереохимия производных dNTP и структура фуранозного остатка играют ключевую роль при взаимодействии с TdT: L-энантиомеры проявляют значительно меньшую активность по сравнению с D-энантиомерами. 5′-Трифосфаты ацикловира (ACVTP) и пенцикловира (PCVTP) приблизительно на два порядка менее эффективны по сравнению с субстратами, имеющими фуранозный остаток. При этом PCVTP является лучшим субстратом по сравнению с ACVTP. На основании этих результатов можно предположить, что гидроксильная группа PCVTP имитирует 3′-гидроксильную группу рибозного остатка и играет важную роль при взаимодействии с TdT.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: