Сравнительный анализ транскрипционных профилей штаммов Нelicobacter pylori^*

Аннотация

Проведено сравнение транскрипционных профилей четырех клинических изолятов Helicobacter pylori (два cag-отрицательные и два cag-положительные) в стационарной фазе роста с использованием кДНК-макроматриц. Коэффициент корреляции между суммарными транскрипционными профилями клинических изолятов H. pylori составил 0,70–0,83. Для 44 групп генов (всего 66), относящихся к разным функциональным классам H. pylori, коэффициент корреляции между изолятами был более 0,7. Для 14 групп генов коэффициент корреляции составил более 0,9. К данной категории принадлежат группы генов, кодирующие процессы клеточного деления, адаптации к атипичным условиям, перенос электронов, утилизацию нуклеозидов и нуклеотидов, гликолиз/глюконеогенез, фолдинг белков и их стабилизацию, факторы трансляции, анаэробность, синтез аминокислот и аминов. Найдено 52 гена, экспрессия которых значительно различается между клиническими изолятами Н. pylori. Часть генов в этой группе определяет вирулентность микроорганизма: цитотоксин-ассоциированный ген (cagA), ген нейтрофил-активирующего белка (napA), ген главного флагеллярного белка (flaА), ген вакуолизирующего цитотоксина (vacA), несколько генов, кодирующих внешние мембранные белки (оmp), некоторые субъединицы уреазы (ureA и ureB), некоторые регуляторные белки, а также гены, кодирующие белки стресса, такие как шапероны и белки теплового шока, groEL и dnaK.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: