БИОХИМИЯ, 2004, том 69, вып. 12, с. 1619–1624
УДК 577.123
Роль N-концевой спирали во взаимодействии рибосомного белка S15 с 16S рРНК
Институт белка Российской академии наук
Поступила в редакцию 19.03.2004
После доработки 20.04.2004
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: РНК-белковые взаимодействия, рибосомные белки, пространственная структура, белок S15, 16S рибосомная РНК.
Аннотация
Ранее было обнаружено, что положение и конформация N-концевой спирали рибосомного белка S15 в несвязанном с 16S рРНК состоянии отличаются при разных условиях, и было сделано предположение, что такая вариабельность необходима белку для узнавания его специфического места на 16S рРНК. Для выяснения справедливости этого предположения нами были проведены замены некоторых аминокислотных остатков этой спирали, оценено их влияние на сродство белка к 16S рРНК, определена кристаллическая структура комплекса одного из мутантов (Тhr3Сys S15) с фрагментом 16S рРНК и построена компьютерная модель комплекса, содержащего другой мутант (Gln8Met S15). Детальный анализ всей имеющейся и полученной информации позволил нам сделать вывод о том, что N-концевая спираль не играет существенной роли в специфическом связывании белка S15 с его мишенью на 16S рРНК.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.