БИОХИМИЯ, 2004, том 69, вып. 8, с. 1118–1128
УДК 577.152.3
Исследование вторичной специфичности энтеропептидазы в сравнении с трипсином
Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Поступила в редакцию 26.12.2003
После доработки 03.02.2004
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: энтеропептидаза, автолиз, трипсин, трипсиноген, пептидные субстраты, химерные белки.
Аннотация
Проведено сравнение вторичной специфичности энтеропептидазы и трипсина с помощью пептидных субстратов энтеропептидазы типа A-(Asp/Glu)n-Lys(Arg)-↓-B, где n = 1–4. Впервые показано, что энтеропептидаза, так же как и другие сериновые протеиназы, обладает протяженным вторичным центром, взаимодействующим с 6-7 аминокислотными остатками, расположенными по обе стороны от расщепляемой пептидной связи. Однако в случае типичных субстратов энтеропептидазы, содержащих четыре отрицательно заряженные остатка Asp/Glu в положениях Р2–P5, превалирующим фактором эффективности гидролиза является электростатическое взаимодействие этих остатков с вторичным центром Lys99 легкой цепи энтеропептидазы. Вторичная специфичность энтеропептидазы отличается от соответствующей специфичности трипсина. Синтетический хромофорный субстрат G5DK-F(NO2)G (kcat/Km=2380 мM–1 · мин–1) оказался более эффективным субстратом энтеропептидазы, чем химерный белок PrAD4K-P26 (kcat/Km = 1260 мM–1 · мин–1).
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.