БИОХИМИЯ, 2004, том 69, вып. 8, с. 1118–1128

УДК 577.152.3

Исследование вторичной специфичности энтеропептидазы в сравнении с трипсином

© 2004 А.Г. Михайлова *, В.В. Лихарева, Б.В. Васьковский, С.К. Гаранин, Л.В. Оноприенко, И.А. Прудченко, Л.Д. Чикин, Л.Д. Румш

Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Поступила в редакцию 26.12.2003
После доработки 03.02.2004

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: энтеропептидаза, автолиз, трипсин, трипсиноген, пептидные субстраты, химерные белки.

Аннотация

Проведено сравнение вторичной специфичности энтеропептидазы и трипсина с помощью пептидных субстратов энтеропептидазы типа A-(Asp/Glu)n-Lys(Arg)-↓-B, где n = 1–4. Впервые показано, что энтеропептидаза, так же как и другие сериновые протеиназы, обладает протяженным вторичным центром, взаимодействующим с 6-7 аминокислотными остатками, расположенными по обе стороны от расщепляемой пептидной связи. Однако в случае типичных субстратов энтеропептидазы, содержащих четыре отрицательно заряженные остатка Asp/Glu в положениях Р2–P5, превалирующим фактором эффективности гидролиза является электростатическое взаимодействие этих остатков с вторичным центром Lys99 легкой цепи энтеропептидазы. Вторичная специфичность энтеропептидазы отличается от соответствующей специфичности трипсина. Синтетический хромофорный субстрат G5DK-F(NO2)G (kcat/Km=2380 мM–1 · мин–1) оказался более эффективным субстратом энтеропептидазы, чем химерный белок PrAD4K-P26 (kcat/Km = 1260 мM–1 · мин–1).

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.