БИОХИМИЯ, 2004, том 69, вып. 5, с. 647–657
УДК 577.152.211
Значение кодонового состава и неравномерности распределения редких кодонов по гену для экспрессии ДНК-метилтрансфераз системы BspLU11III
1 Институт белка РАН
2 Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
Поступила в редакцию 21.07.2003
После доработки 16.09.2003
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ДНК-метилтрансфераза, редкие кодоны, pRARE, CAI, E(g).
Аннотация
Гены двух ДНК-метилтрансфераз (адениновой М.BspLU11IIIa и цитозиновой М.BspLU11IIIb), принадлежащих системе рестрикции–модификации типа IIG BspLU11III из термофильного штамма Bacillus species LU11, экспрессированы в Escherichia coli. Эти гены содержат большое количество редких для E. coli кодонов и характеризуются одинаковыми значениями индекса кодонового соответствия (CAI) и показателя степени экспрессии (E(g)). Однако в гене адениновой ДНК-метилтрансферазы редкие кодоны расположены диффузно по гену, а в гене цитозиновой ДНК-метилтрансферазы содержатся кластеры редких кодонов. Введение в клетку плазмиды pRARE, несущей гены тРНК шести редких для E. coli кодонов, в ~7,3 раза повышает эффективность экспрессии гена цитозиновой ДНК-метилтрансферазы и всего в 1,25 раза адениновой. Можно предположить, что плазмида с генами минорных тРНК способна сильно увеличивать экспрессию генов только с кластерным расположением редких кодонов. Обе ДНК-метилтрансферазы выделены и очищены с помощью хроматографии на гепарин-сефарозе, фосфоцеллюлозе и гель-фильтрации на сефадексе G-75 до гомогенного состояния (по данным Ds-Na-ПААГ-электрофореза).
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.