БИОХИМИЯ, 2004, том 69, вып. 2, с. 164–171

УДК 577.213.3

Взаимодействие обратной транскриптазы ВИЧ-1 с модифицированными олигонуклеотидными праймерами, содержащими 2'-O-β-D-рибофуранозиладенозин

© 2004 А.С. Голубева 1, Б.С. Ермолинский 1, E.В. Ефимцева 1, В.Л. Туницкая 1, A. ван Аершот 2, П. Хердевин 2, С.Н. Михайлов 1, С.Н. Кочетков 1*

1 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

2 Рега институт, Католический университет Леувена

Поступила в редакцию 21.04.2003
После доработки 27.06.2003

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ВИЧ-1, обратная транскриптаза, 2'-O-β-D-рибофуранозиладенозин, олигонуклеотиды, ингибиторный анализ, компьютерное моделирование.

Аннотация

В качестве праймеров в РНК-зависимом синтезе ДНК, катализируемом обратной транскриптазой ВИЧ-1, использованы синтетические модифицированные олигодезоксирибонуклеотиды, содержащие 2′-O-β-D-рибофуранозиладенозин. Степень элонгации праймеров зависела от положения дополнительного рибозного звена, причем его наличие в специфической позиции праймера (–4) (и только в ней) полностью предотвращало элонгацию. Методами молекулярной графики проведено моделирование связывания модифицированных праймеров в активном центре обратной транскриптазы и показано, что причиной отсутствия элонгации в указанном выше случае являются стерические препятствия, возникающие при взаимодействии дополнительного рибозного остатка с участком ОТ 262–270, взаимодействующим с ДНК-субстратом в области малой бороздки.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.