Взаимодействиe порина из Yersinia pseudotuberculosis с различными структурными вариантами эндогенных липополисахаридов

Аннотация

Методом тушения собственной белковой флуоресценции изучено взаимодействие порина из бактерий Yersinia pseudotuberculosis, солюбилизированного в дезоксихолате натрия, c R- и S-формами эндогенного липополисахарида (ЛПС). Образцы S-ЛПС различались длиной O-специфического полисахарида (число повторяющихся звеньев, или степень полимеризации, n = 1 и 4) и степенью ацилирования остатков 3-гидрокситетрадекановой кислоты в липиде A (12–66%). Обнаружено, что R-ЛПС с низкой степенью ацилирования липида A (12%) связывается с порином с положительной кооперативностью на взаимозависимых сайтах двух типов, локализованных в области олигосахарида кора и липида A молекулы R-ЛПС. Характер взаимодействия порина и S-ЛПС с низкой степенью ацилирования (15 и 20%) соответствует модели связывания по трем типам специфических сайтов. Форма кривых связывания S-ЛПС в координатах Скэтчарда свидетельствуют о том, что образование комплекса S-ЛПС–порин при низких и средних концентрациях лиганда является кооперативным процессом, а при концентрации, близкой к насыщению лигандом, связывание происходит на двух типах независимых сайтов. Присутствие O-специфической полисахаридной цепи в молекуле S-ЛПС приводит к более высокоаффинному взаимодействию лиганда с порином, чем в случае связывания с R-ЛПС. Значительное увеличение степени ацилирования остатков 3-гидрокситетрадекановой кислоты в липиде A (66%) и соответственно увеличение гидрофобности молекулы S-ЛПС приводят к кардинальному изменению в связывании с порином: процесс становится антикооперативным и менее аффинным. Таким образом, определяющими характер взаимодействия ЛПС с порином являются изменения в конформации ЛПС, вызванные увеличением гидрофобной области макромолекулы.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: