БИОХИМИЯ, 2001, том 66, вып. 11, с. 1588–1608

УДК 577.354

Кинетика и pH-зависимость светоиндуцированного депротонирования Шиффова основания родопсина: возможное сопряжение с поглощением протона и образованием активной формы метародопсина II

© 2001 О. Кувата 2,3, Ч. Юан 2, С. Мисра 2,4, Р. Говинджи 2, Т. Ибри 1*

Departments of Botany and Zoology, University of Washington

Center for Biophysics and Computational Biology, and Department of Biochemistry, University of Illinois

Institute of Biological Science, University of Tsukuba

Laboratory of Molecular Biology, National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Disorders, National Institutes of Health

Поступила в редакцию 08.06.2001
После доработки 12.07.2001

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: родопсин, светоиндуцированное депротонирование, Шиффово основание, pH-зависимость.

Аннотация

Вначале этого обзора рассмотрены кинетика образования метародопсина (Meta II), стехиометрия и роль протонов в его формировании, кинетика светоиндуцированных изменений концентрации протонов, а также участок их поглощения. Далее сопоставлены процессы, ведущие к депротонированию Шиффова основания у бактериородопсина и родопсина. Сходство светоиндуцированных электрических сигналов, получаемых от этих двух типов ориентированных мембранных пигментных молекул, может быть объяснено высвобождением протона бактериородопсином во внеклеточную среду и поглощением протона родопсином из цитоплазмы. Далее приведены результаты исследований pH-зависимости спектра поглощения нефотолизированного бычьего родопсина, амплитуды и кинетики образования Meta II. Мы также исследовали влияние дейтерирования и введение азида на образование Meta II. Данные этих экспериментов свидетельствуют в пользу того, что рКа противоиона Шиффова основания и поверхностного аминокислотного остатка, который поглощает протон при фотолизе, в нефотолизированном состоянии менее 4. Исследование pH-зависимости образования Meta II показало, что механизмы, участвующие в последовательном обесцвечивании пигмента, значительно сложнее превращения двух изоспектральных форм Meta II. В заключительной части представлены данные, свидетельствующие о том, что подобно бактериородопсину протонирование противоиона Шиффова основания (Glu113) сопряжено с изменением pKa протонируемой поверхностной группы, именуемой в случае родопсина Z-группой, роль которой может играть Glu134. Мы полагаем, что такое сопряжение, по-видимому, ведет к образованию активной формы Meta II.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.