БИОХИМИЯ, 2001, том 66, вып. 11, с. 1555–1569
УДК 577.354
Молекулы внутренней воды как мобильные полярные группы при фотоиндуцированной транслокации протона в бактериородопсине. Исследование методом разностной инфракрасной спектроскопии с преобразованием Фурье
Обзор
Center for Biophysics and Computational Biology and Department of Biochemistry, University of Illinois at Urbana/Champaign
Поступила в редакцию 08.04.2001
После доработки 09.05.2001
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: водородные связи, инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье, молекулы внутренней воды, бактериородопсин, родопсин.
Аннотация
Инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (ИКСФП) позволяет выявить изменения полярных химических связей, от которых зависят функции бактериородопсина. Изменение в H-связывании Asp85, Asp96, основания Шиффа, а также молекул внутренней воды вблизи этих аминокислотных остатков при образовании фотоинтермедиатов L, M, и N бактериородопсина исследовали методом разностной ИКСФП. Локализацию и взаимодействие молекул этой воды с аминокислотными остатками изучали с помощью мутантных пигментов. Молекулы внутренней воды в цитоплазматическом домене могут функционировать как мобильные полярные группы в неполярном окружении, а также участвовать в стабилизации интермедиата L, перенося протон между основанием Шиффа и акцептором или донором протона. Такие же молекулы внутренней воды были обнаружены в бычьем родопсине.