БИОХИМИЯ, 1999, том 64, вып. 7, с. 914–923
УДК 577.124.5
Структура О-полисахарида липополисахарида Pseudomonas syringae рv. garcae icmp 8047
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: липополисахарид, О-специфический полисахарид, 3-ацетамидо-3, 6-дидезокси-D-галактоза, структурная гетерогенность Pseudomonas syringae.
Аннотация
Состав и строение О-полисахарида липополисахарида фитопатогенной бактерии Pseudomonas syringae pathovar garcae ICMP 8047 изучены с помощью метилирования, распада по Смиту и 1Н- и 13С-ЯМР-спектроскопйй, включая двумерную корреляционную спектроскопию (COSY), полную корреляционную спектроскопию (TOCSY), спектроскопию ядерного эффекта Оверхаузера (NOESY) и гетероядерную 1Н,13С-мультиквантовую корреляционную спектроскопию с детектированием протонов (HMQC). Найдено, что полисахарид содержит L-рамнозу и 3-ацетамидо-3,6-дидезокси-D-галактозу (D-Fuc3NAc) в соотношении 4 : 1 и построен из двух типов пентасахаридных повторяющихся звеньев. Основное (1) и минорное (2) повторяющиеся звенья отличаются друг от друга только положением замещения одного из остатков рамнозы в основной цепи. Такой тип структурной гетерогенности был описан ранее для О-полисахаридов ряда других штаммов Р. syringae, имеющих сходный моносахаридный состав. Остаток Fuc3NАс присоединен к основной рамнановой цепи в качестве бокового ответвления (α1→4)-гликозидной связью, которая ранее не была описана у Р. syringae: α-D-Fucp3NAc 1 ↓ 4 →2)-α-L-Rhap-(1→2)-α-L-Rhap-(l→3)-α-L-Rhap-(l→3)-α-L-Rhap-(l→ 1 α-D-Fucp3NAc 1 ↓ 4 →3)-α-L-Rhap-(l→2)-α-L-Rhap-(l→3)-α-L-Rhap-(l→3)-α-L-Rhap-(l→ •2