БИОХИМИЯ, 1998, том 63, вып. 6, с. 749–754
УДК 577.152.1
Существование центра связывания индолил-3-уксусной кислоты в пероксидазах растений. Структурное сходство пероксидаз и ауксин-связывающих белков
Поступила в редакцию 17.02.1998
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: дистальный домен, активный центр, пероксидаза хрена, картирование, структурносходные участки, субстрат-связывающий центр.
Аннотация
С помощью компьютерных методов было показано, что аминокислотные последовательности пероксидаз растений и ауксин-связывающих белков содержат близкие по структуре участки. Картирование структурно сходных участков проведено с использованием модельной структуры пероксидазы хрена. Пять из шести структурно сходных участков находятся в составе дистального домена пероксидаз и формируют субдомен, включающий последовательность, координирующую гем с дистальной стороны активного центра, LHFHDC (остатки 39-44 в молекуле пероксидазы хрена). Обсуждается существование центра связывания индолил-3-уксусной кислоты в составе дистального субдомена, включающего спирали А (целиком), В (середина), С (начало), D (целиком) и перехода от спирали D к D’.