БИОХИМИЯ, 1996, том 61, вып. 12, с. 2092–2098
УДК 577.151.01
Метод расчета доступности растворителю ароматических аминокислотных остатков белков в водно-органических смесях
Поступила в редакцию 21.02.1996
После доработки 19.07.1996
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: доступность растворителю, водно-органическая среда, производная спектроскопия, триптофан, тирозин.
Аннотация
Предложен метод расчета доступности растворителю остатков триптофана и тирозина белка в водно-органических смесях по вторым производным УФ-спектра, Использование вторых производных спектра позволяет отличить непосредственный эффект, оказываемый органическим растворителем на спектральные характеристики экспонированных ароматических аминокислотных остатков в белке, от эффекта влияния органического растворителя на конформацию белка, Метод применим для расчета экспонированности остатков триптофана в водно-органических смесях в тех белках, в которых число тирозиновых остатков не превышает числа триптофановых. Аналогичный метод расчета экспонированности остатков тирозина применим для белков, в которых содержание тирозина не менее чем в 5 раз превышает содержание триптофана. В качестве примера рассчитана доступность для растворителя триптофановых остатков химотрипсина в присутствии различных органических растворителей: этилового спирта, диоксана и диметилформамида.