БИОХИМИЯ, 1985, том 50, вып. 10, с. 1694–1701
УДК 577.152
Сайт-специфичность ДНК-метилаз из клеток Shigella sonnei 47
Институт медицинской энзимологии АМН СССР, Москва
Поступила в редакцию 08.02.1985
Аннотация
Использование комплексного подхода, включающего изоплитный анализ, ферментативную обработку метилированных изоплит и последующий компьютерный анализ позволили определить сайт-специфичность шести метилаз из клеток Shigella sonnei 47, обозначенных в соответствии со специфичностью к азотистому основанию и изоэлектрической точкой MC4,2, MC5,3, MC6,2, MC7,4, MC8,4 и MA9,5. Установлено, что сайтом узнавания MA9,5 является палиндромная шестичленная структура типа 5′…GA*ATTC…3′ и этот фермент является изометимерным по отношению к MEco RI. Сайт узнавания представляет собой впервые установленную для метилаз несимметричную четырехчленную последовательность 5′…NCC*CCN…3′, отличающуюся уникальной сплоченностью цитозинов. MC8,4 обладает широкой специфичностью узнавания субстрата и метилирует остаток цитозина в составе несимметричной уникальной последовательности 5′…N(C/Pu)CCN…3′,5′-концевое основание которой вырождено по трем нуклеотидам. Показано, что MC5,3 метилирует 3′-концевой цитозиновый остаток в составе пентануклеотидного палиндромного сайта узнавания 5′…CC*NGG…3′. MC6,2 и MC7,4 имеют идентичные пентануклеотидные сайты узнавания 5′…(Py)C*NG(Pu)…3′, однако различаются по изоэлектрическим точкам, что впервые показано для различных метилаз в составе одного штамма.