БИОХИМИЯ, 1985, том 50, вып. 9, с. 1553–1559
УДК 547.963.3
Характеристика палиндромных последовательностей в ДНК морского ежа Strongylocentrotus intermedius
Институт биологии моря ДВНЦ АН СССР, Владивосток
Поступила в редакцию 05.11.1984
Аннотация
В ядерной ДНК морского ежа S. intermedius охарактеризована фракция палиндромных последовательностей. С использованием хроматографии на оксиапатите и обработки S1-нуклеазой показано, что доля палиндромных последовательностей возрастает более чем вдвое при увеличении в растворе концентрации натрия или снижении температуры реассоциаций. Увеличение обусловлено вовлечением в реассоциацию инвертированных повторов, которые характеризуются значительной негомологичностью и/или наличием протяженного разделяющего участка ДНК. Методом реассоциации «пикированной» палиндромной фракции с избытком тотальной гомологичной ДНК обнаружено, что большая часть инвертированных повторов в геноме морского ежа — уникальные последовательности. Сложность палиндромной фракции оценена в 8,2 · 107 нуклеотидных пар, количество палиндромов на гаплоидный геном ~500000.