БИОХИМИЯ, 1985, том 50, вып. 6, с. 1039–1051
УДК 577.152.3
Моделирование аллостерического поведения фосфофруктокиназы из мышц кролика, определяемого действием адениловых нуклеотидов
Всесоюзный научно-исследовательский институт прикладной молекулярной биохимии и генетики, Москва
Поступила в редакцию 30.11.1984
Аннотация
Разработан комплекс программ, первая часть которого предназначена для расчета концентраций различных ионных форм метаболитов в сложной системе равновесий типа металл — смесь лигандов — H+-ионы, а вторая часть проводит математическое моделирование аллостерической кинетики на основе модели Моно — Уаймена — Шанже. Расчет соотношения различных компонентов системы Mg2+ — AMP, ADP и ATP использован при полуколичественном описании регуляции фосфофруктокиназы из мышц кролика под действием этих аденилатов при pH 7,0, 7,5 и 8,0. При помощи оптимизации по совокупности четырех экспериментальных кривых сеточным методом на ЭВМ возможно определение взаимосогласованных значений параметров модели, что позволяет дать, «унифицированное» описание всех экспериментальных данных (48 кривых). Проведено сравнение 14 вариантов модели, различающихся числом pH-зависимых параметров и рассматриваемых ионных форм ATP. Проанализирована статистическая достоверность различий между ними. Найдены «оптимальная» и «минимальная» модели, дающие соответственно наиболее точное и наиболее унифицированное описание экспериментальных данных. Выделено аллостерическое действие свободной ATP и ее комплекса с Mg2+. Из расчетов следует, что свободная форма ATP является активатором фосфофруктокиназы с очень высоким сродством, а комплекс Mg-ATP2− — ингибитором (по регуляторному центру).