БИОХИМИЯ, 1985, том 50, вып. 1, с. 32–46
УДК 577.17
Компьютерный банк аминокислотных последовательностей белковых гормонов. Анализ эволюционных, конформационных и физико-химических свойств отдельных участков последовательностей в суперсемействах проинсулина и проглюкагона
Институт экспериментальной эндокринологии и химии гормонов АМН СССР, Москва
Поступила в редакцию 24.11.1984
Аннотация
Построены схемы соответствия между семействами аминокислотных последовательностей из разных видов животных для двух суперсемейств белково-пептидных гормонов и их предшественников: суперсемейства проинсулина — ИРФ* — прорелаксина и суперсемейства проглюкагона — про(ПНМ-ВИП) — просоматокринина. На базе этих схем проведено локальное сравнение последовательностей внутри и между семействами; для каждого семейства построены усредненные профили вероятной вторичной структуры отдельных участков последовательностей (по Чоу и Фасману) и усредненные профили их физико-химических свойств — гидрофобности и объема боковых радикалов аминокислот. На основании анализа этих профилей выдвинуто предположение о том, что несмотря на вероятное сходство ИРФ и релаксина с инсулином по пространственному строению их молекулы, в релаксине отсутствует инсулиноподобный рецепторный (эффекторный) участок, а в ИРФ он модифицирован дополнительными звеньями пептидной цепи. На основании перекрестного сравнения просоматокринина с проглюкагоном и про(ПНМ-ВИП) выдвинуто предположение о том, что C-концевой фрагмент просоматокринина, отделенный от соматокринина одиночным аргинином, является вторым в этом предшественнике глюкагоноподобным пептидом, возможно, обладающий биологической активностью.