БИОХИМИЯ, 1983, том 48, вып. 12, с. 1939–1953
УДК 577.17
Компьютерный банк аминокислотных последовательностей белковых гормонов. Сравнительный анализ последовательностей в группе проопиомеланокортина, проэнкефалина и продинорфина: обнаружение форфина — четвертого повторяющегося пептида в продинорфине
Аннотация
На базе ЭВМ БЭСМ-6 создана компьютерная система накопления и сравнительного анализа аминокислотных последовательностей (АП) белково-пептидных гормонов и их предшественников, или так называемый машинный банк АП белковых гормонов. Разработана программа на Фортране, предназначенная для построения схем соответствия АП и профилей их локального сходства. Совместно с разработанными ранее программами она позволяет быстро включать вновь расшифрованную последовательность в соответствующую гомологическую группу, расширяя тем самым ее схему соответствия и уточняя эволюционные профили. Сравнительный анализ АП в группе проопиомеланокортина (ПОМК), проэнкефалина (ПЭНК) и продинорфина (ПДИН) выявил в них эволюционно-консервативные и вариабельные участки. Консервативные участки АП являются активными центрами гормонов. В продинорфине обнаружен аналог лей-энкефалина форфин — четвертый повторяющийся пептид в этом предшественнике, который так же, как β-нео-эндорфин, динорфин и риморфин, может обладать биологической активностью. Выявлено сходство эффекторных участков ряда меланотропина из ПОМК с рядом мет-энкефалина из ПЭНК и лей-энкефалина из ПДИН, а также гастрина и холецистокинина, что может свидетельствовать о сходстве гормон-рецепторных комплексов в органах-мишенях этих гормонов.