БИОХИМИЯ, 1982, том 47, вып. 5, с. 713–723
УДК 547.96
Зондирование линейного распределения нуклеосом в хроматине
Аннотация
Исследовали связывание красителей-антибиотиков с хроматином, фрагментированным различными способами, и препаратами «полных» (MH3, 206 пар оснований ДНК) и «малых» (MH1, 175 пар оснований ДНК) нуклеосом. Последние выделяли препаративным электрофорезом в полиакриламидном геле из тотального гидролизата хроматина ядер Ca,Mg-зависимой эндонуклеазой. Показано, что в хроматине печени различных позвоночных связывание актиномицина D снижено, по сравнению с ДНК, на 70%, тогда как бромида этидия — только на 40%. Расщепление части межнуклеосомной ДНК Ca,Mg-зависимой эндонуклеазой приводит к дальнейшему уменьшению числа мест связывания для бромида этидия, но не для актиномицина D. Установлено, что MH3 связывают 24 молекулы актиномицина D на 103 нуклеотидов, а их ДНК содержит 43,3% GC-пар. В MH1 содержание GC-пар достигает 47,7%, и они связывают 28 молекул красителя на 103 нуклеотидов. Полученные данные рассматриваются в аспекте возможной предпочтительности локализации сердцевин нуклеосом по участкам ДНК, обогащенным GC-парами.