БИОХИМИЯ, 1980, том 45, вып. 7, с. 1245–1266
УДК 577.154
Выбор модели ассоциации фосфофруктокиназы из мышц кролика методом математического моделирования
Научно-исследовательский институт по биологическим испытаниям химические соединений, Купавна, Московской области
Химический факультет Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова
Поступила в редакцию 23.08.1979
Аннотация
Методом скоростного центрифугирования изучено седиментационное поведение в различных условиях субформы фосфофруктокиназы из мышц кролика, специфически элюируемой с ДЭАЭ-целлюлозы цитратом. Показано, что многообразие определяемых значений коэффициентов седиментации отдельных компонентов системы можно разделить на 12 групп, что является, по-видимому, свидетельством многоступенчатого характера ассоциации фермента (более 3 олигомеров). Изучена концентрационная зависимость средневесового коэффициента седиментации фосфофруктокиназы. Выбор возможной модели ассоциации олигомеров этого фермента проводился путем математического моделирования процесса ассоциации в области низких концентраций белка на ЭВМ. Из 26 рассмотренных конечных моделей ассоциации фосфофруктокиназы 14 моделей с 2 или 3 константами ассоциации являются неразличимыми с точки зрения t — критерия значимости Стыодента. Все рассмотренные однопараметрическне модели достоверно плохо описывают экспериментальные данные. Предполагается, что димер не является структурной единицей полимеризации. С учетом этого, а также требования многоступенчатости процесса ассоциации выбрано 8 наиболее вероятных моделей ассоциации фосфофруктокиназы типа мономер — димер — тример — тетрамер, мономер — димер — тетрамер — октамер (с тремя константами ассоциации) и линейной полимеризации вплоть до октамера с двумя константами ассоциации, где «мономером» ассоциации могут являться тримеры, тетрамеры или гексамеры субъединиц.