Эпигенетические модификации ДНК-(цитозин-5-C): 5-аза-2'-дезоксицитидин и деметилирование ДНК^*

Аннотация

Метилирование ДНК (образование цитозина-5-С) – одна из уникальных особенностей модификации хроматина млекопитающих. Характерная последовательность метилирования может приводить к возникновению сродства либо, наоборот, к невозможности связывания с CpG-островками, взаимодействующими с цитозинсвязывающими белками. Последние также могут определять модификации гистонов и динамические переходы между транскрипционно активными и неактивными состояниями хроматина. Механизм деметилирования, ферменты c деметилазной активностью и связанные с ними кофакторы еще не точно определены. Показано, что использование азануклеотидов, таких как 5-азацитидин и 5-аза-2′-дезоксицитидин (AzadC), в клеточной культуре вызывает экспрессию генов, находившихся под гиперметилированными CpG-богатыми промоторами. Возникло предположение о том, что AzadC – деметилирующий агент. Обсуждаются следующие вопросы: химическое определение и недавние достижения в отношении механизма метилирования (цитозин-5-С)-ДНК (образования ^MeCpG-ДНК или ^MeCpNpG-ДНК) и ^MeCpG/^MeCpNpG-ДНК-деметилирования, а затем – механические основы инактивации DNMT1 с помощью AzadC. Показано, что: AzadC не имеет отношения к деметилированию ДНК; он не может предотвратить даже метилирование de novo в нереплицирующихся клетках; он может лишь предотвратить связанное с поддержанием репликации метилирование, а также метилирование de novo. Высказано предположение, что обозначение AzadC как ДНК-деметилирующего агента является неправильным использованием химии и химической терминологии.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: