Протеомный анализ мха Physcomitrella patens (Hedw.)  B.S.G.^*

Аннотация

Для построения референтной протеомной карты мха Physcomitrella patens, основанной на полной нуклеотидной последовательности генома, проведены двумерные электрофорезы белков, изолированных из протопластов, протонемы и гаметофоров мха. На гелях, обработанных серебром, разрешено в зависимости от фазы развития мха от 500 до 600 белковых пятен. Анализ пептидов, полученных в результате трипсинолиза белков, методом MALDI-TOF-масс-спектрометрии («пептидного отпечатка») позволил идентифицировать 212 индивидуальных белков. В целях расширения спектра изучаемых белков проведен одномерный гель-электрофорез белков экстракта в денатурирующих условиях с последующим анализом триптических пептидов методом LC-ESI-MS/MS. С помощью предложенного метода определено еще 186 белков. Применительно к 398 белкам, идентифицированным двумя методами, проведена классификация в соответствии с системой кластеризации ортологичных генов. Установлено, что 16% белков участвуют в различных клеточных процессах и передаче сигнала, 26% – в процессах метаболизма, 7% – в процессинге и хранении генетической информации. В результате протеомного анализа с использованием флуоресцентных красителей, конъюгированных с белками в тотальных препаратах, обнаружены различия между двумя основными фазами жизненного цикла мха – протонемой и гаметофорами. Выявлены достоверные различия в белковом спектре протопластов, изолированных из протонемы, – они существенно отличаются по составу белков как от протонемы, так и от гаметофоров.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: