БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 2, с. 216–228
УДК 577.152.6
Взаимодействие фенилаланил-тРНК-синтетазы человека со специфичной тРНК по данным тиофосфатного футпринтинга*
1 Институт химической биологии и фундаментальной
2 Новосибирский государственный университет
Поступила в редакцию 23.06.2008
После доработки 10.07.2008
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: нуклеозид-5'-О-(1-тиотрифосфат), тРНКPhe, фенилаланил-тРНК-синтетаза человека, футпринтинг.
Аннотация
Взаимодействие цитоплазматической фенилаланил-тРНК-синтетазы человека (фермента с неизвестной трехмерной структурой) с гомологичной тРНКPhe в функциональных условиях изучено с помощью метода футпринтинга, основанного на расщеплении тиофосфатзамещенных тРНК-транскриптов йодом. В районы эффективно и среднезащищенных фосфатных групп нуклеотидов входит большинство элементов узнавания тРНКPhe этим ферментом: G34 в антикодоне, две пары антикодонового стебля (G30–C40, A31–U39) и G20 в D-петле. Другие важные элементы специфичности, А35 и А36, входят в зону слабых неспецифических контактов. В образовании непрерывных контактов рибозофосфатного скелета тРНКPhe с ферментом участвуют D-стебель, Т-ветвь и акцепторный стебель, что не исключает наличия в этих районах дополнительных элементов узнавания. Полученные данные свидетельствуют о различных механизмах взаимодействия фенилаланил-тРНК-синтетаз со специфичными тРНК в про- и эукариотах.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in press, BM-212, 21.12.2008.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.